Cancer de prostată: datele mari deblochează 80 de noi ținte de droguri
În cel mai mare studiu de analiză a geneticii cancerului de prostată, oamenii de știință găsesc nu mai puțin de 80 de noi potențiale ținte de droguri. Proiectul deschide căi largi pentru proiectarea de noi tratamente.
Extragerea datelor genetice a fost, odată, o sarcină greoaie și incredibil de consumatoare de timp.
Cu toate acestea, pe măsură ce tehnologia continuă să se îmbunătățească, postul a devenit semnificativ mai rapid și mai ieftin.
În paralel, instrumentele disponibile pentru gestionarea seturilor de date mari s-au îmbunătățit considerabil.
Luate împreună, aceasta înseamnă că oceanele de informații recoltate din codul genetic pot fi analizate, mapate și combinate cu o ușurință relativă pentru a oferi un nou nivel de claritate.
Recent, o echipă internațională a folosit această abordare dublă a analizei ADN și a datelor mari pentru a aprofunda genetica cancerului de prostată. În căutarea unor ciocniri moleculare în armura bolii, cercetarea a fost orchestrată de Institutul de Cercetare a Cancerului din Londra, Regatul Unit.
Provocări ale cancerului de prostată
Cancerul de prostată este al doilea cel mai frecvent cancer în rândul bărbaților din Statele Unite. Anul acesta, în SUA, se vor estima 164.690 de cazuri noi de cancer de prostată și aproape 30.000 de decese cauzate de boală.
Deși cercetătorii au făcut progrese în înțelegerea și tratarea cancerului de prostată, există încă o serie de dificultăți.
După cum explică liderul studiului, prof. Rosalind Eeles, „Una dintre provocările cu care ne confruntăm în cercetarea cancerului este complexitatea bolii și numărul mare de moduri în care am putea-o trata”.
Dr. Justine Alford, de la Cancer Research UK, subliniază o altă problemă în studierea și intervenția în cancerul de prostată.
„Un obstacol major pentru a face progrese suplimentare împotriva cancerului de prostată”, explică ea, „este lipsa unor modalități de a prezice cu exactitate modul în care boala unei persoane va progresa, ceea ce face dificil să știm care tratament este cel mai bun pentru fiecare pacient”.
Recoltarea datelor genetice
Pentru a aborda problema dintr-o nouă direcție, cercetătorii au preluat informații genetice de la 112 bărbați cu cancer de prostată și le-au combinat cu date dintr-o serie de alte studii. În total, au fost utilizate probe de la 930 de pacienți.
Folosind cele mai recente tehnici de big data, echipa a obținut noi perspective asupra schimbărilor genetice care declanșează dezvoltarea și alimentează progresul cancerului de prostată. Odată ce au înțeles care gene sunt implicate, ar putea crea o hartă a proteinelor care sunt codificate de aceste gene.
Apoi, au apelat la o bază de date numită canSAR, care combină datele din studii, aplică învățarea automată și ajută la furnizarea de informații despre descoperirea medicamentelor.
Pe site-ul lor, canSAR explică întrebările la care baza lor de date își propune să răspundă: „Ce se știe despre o proteină, în care tipuri de cancer este exprimată sau mutată și ce instrumente chimice și modele de linii celulare pot fi utilizate pentru a testa experimental activitatea sa? Ce se știe despre un medicament, profilul său de sensibilitate celulară și ce proteine se știe că se leagă, care pot explica bioactivitatea neobișnuită? ”
Oamenii de știință au descoperit că 80 dintre proteinele pe care le-au descoperit erau potențiale ținte de droguri. Și, 11 dintre acestea au fost vizate de medicamentele existente, iar alte șapte ar putea fi vizate de medicamente deja în studiile clinice.
Descoperirile lor sunt publicate săptămâna aceasta în jurnal Genetica naturii.
„Studiul nostru a aplicat tehnici de ultimă oră în analiza datelor mari pentru a debloca o mulțime de informații noi despre cancerul de prostată și modalitățile posibile de combatere a bolii.”
Prof. Rosalind Eeles
Privind spre viitor
Descoperirile vor necesita studii suplimentare înainte de a putea fi utilizate clinic, desigur, dar oferă o serie de noi posibilități.
Așa cum explică co-autorul prof. Paul Workman, „Acest studiu a descoperit un număr remarcabil de mare de gene noi care determină dezvoltarea cancerului de prostată și ne-a oferit informații vitale despre modul de exploatare a biologiei bolii pentru a găsi potențiale noi tratamente. ”
El speră că munca lor va stimula un val de noi cercetări în ceea ce privește modificările genetice și potențialele ținte de droguri pe care le-au identificat, cu scopul ca pacienții să beneficieze cât mai curând posibil.
Un alt obstacol în proiectarea tratamentelor pentru cancerul de prostată este modul în care boala progresează diferit la fiecare individ. Acest lucru face mult mai dificil să se decidă ce opțiuni de tratament sunt cele mai potrivite pentru fiecare pacient.
Dr. Alford speră că „[b] ne va îmbunătăți înțelegerea genetică din spatele bolii, […] în viitor, aceste cunoștințe ar putea ajuta medicii să adapteze mai bine tratamentele la cancerul unei persoane și, sperăm, să vadă mai mulți oameni să supraviețuiască bolii lor. ”
Acestea sunt primele zile, dar concluziile care vor veni de la următoarea generație de studii ar putea fi transformatoare în domeniu.
